真如寺に伝わる上総武田氏系図では、其二では真里谷武田氏の系図のみを、其三では庁南武田氏と真里谷武田氏を併せた系図となっている。同じ上総武田氏の系図だが、微妙に内容が異なっている。
上記①上総武田氏系図其三と③上総武田氏其二を比較して決定的な違いは、武田信高を武田信定と書かれていることである。
更に官位についても①と③では異なっている。

武田信長が文明9年（1477年）、武田信高が文明12年（1480年）に相次いで没すると、上総武田氏にお家騒動が勃発する。このことが庁南武田氏と真里谷武田氏に分裂することにつながるのである。

• 武田信長が隠居し真里谷城に移り、嫡子武田信高が庁南城を居城としたことにより、二頭体制となったことで家臣たちが真里谷派と庁南派に分かれて対立する構造が出来てしまった。例として徳川家康が駿府に隠居し、江戸の将軍秀忠との二頭体制があげられる。家康が没すると側近だった本多正純が宇都宮城釣り天井事件で没落し、秀忠の側近土井利勝が頭角を現すことになる。
• 上総国の正当な支配者であることを国人たちに誇示してきた上総介信高の後継者に真里谷城にいた武田信興はならなかったのである。上総介信高の意向なのか真里谷城の人たちの反対で本人が辞退したのか理由はわからない。
• 上総介の地位と庁南城主は、武田信興の弟武田道信が継承することになる。
• 武田信興が上総介を軽視し真里谷城を居城としたのも、武田氏が甲斐源氏出身で上総国に多くの支城を有している自信の表れだった。しかし、古河公方配下の諸侯の序列では、千葉介に次いで上総介が位置しており、武田三河守は上総介より下位に位置してしまうのである。
• 関東の諸侯で千葉介が歴代首座を占めてきたことは、後の戦国時代に上杉謙信（当時は政虎）が鶴岡八幡宮で関東管領の就任式を行った際に千葉介胤富が小山高朝と首座争いを行い、上杉謙信が千葉介胤富の主張を認めたことで有名である。関東の諸侯首座の千葉介に重視された上総介の立場は決して侮れないものだった。
• このようなことが真里谷武田氏にとってどれほどコンプレックスだったかが上総武田氏系図を見るとよくわかる。武田信長や武田信高（信定）に生実御所執権とか両総管領という肩書きをつけているのは、千葉介・上総介に対抗するためである。執権は鎌倉幕府の役職、管領は室町幕府の役職、生実御所は小弓公方足利義明の邸宅のあった場所のことであるが、信長・信高の時代に生実御所が存在していなかったことは明言できる。当時存在していなかった役職などで系図を飾らなければ千葉介・上総介に対応できなかったのである。
• そして真里谷武田氏を庁南城を居城とする上総介道信を同等にするため、兄上総介信高を道信・信興の父とすることで歴史的事実を改ざんしてしまった。
• これにより、武田道信が庁南武田氏初代となり、武田信興が真里谷武田氏初代初代となった。この結果が上総武田氏系図其三である。武田道信は兄武田信興の意向に従ったが家督相続後1年で没した。その子武田宗信が上総介を継承すると、真里谷武田氏との関係が疎遠になり千葉宗家との関係を重視するようになる。

• 兄上総介信高を父としたが、上総武田氏系図其二では信高を信定に改め「武田和泉守として真里谷城に住む。地名の真里谷から真里谷氏を称す。」と記したのだ。庁南城主上総介信高の存在を系図其二で完全否定し、父にしてしまった信定の代から真里谷城に住み真里谷信定と称し真里谷氏の正当性を強調した。